Le CHUK héberge depuis son ouverture la Faculté de Médecine de l’Université du Burundi.
Créé le le 28/12/1984 par le décret N°100/121, le CENTRE HOSPITALO-UNIVERSITAIRE DE KAMENGE est une administration personalisée, placée sous la tutelle du Recteur de l'Université du Burundi selon l'ORDONANCE MINISTERIELLE N°6101/1175 du 11/12/2006 PORTANT MODIFICATION DES MODALITES DE FONCTIONNEMENT DU CENTRE HOSPITALO-UNIVERSITAIRE DE KAMENGE